高考制度体现着实现教育分层的筛选功能，它分为考试制度和招生制度两个不同的方面。近年来的高考改革，主要集中在考试科目、内容、方法的改革，而对招生制度几无触动。事实上，就保障教育公平而言，最需要改革的是招生制度。它对教育公平的影响，表现在以下几个方面。
一、不均衡的配额制度导致严重的地区差距。我国现行的统一高考制度，具备了形式上的公平——分数面前人人平等；但实际录取学生采取的是分省定额、划线录取的办法，各地录取定额并非按考生数量平均分配，而是按各地高教资源的状况，以及优先照顾城市考生的准则。因此，出现各地之间录取率、录取分数线的极大差异，最大可达一百分左右。这种“倾斜的高考分数线”，加剧了地区和城乡之间原已存在的教育不平等。究其原因，这主要是由于历史形成的高等教育资源分布的不合理。此外，在计划经济时代，公共政策是以“中央”、“国家”为中心的，较少考虑城乡、地区和阶层之间的利益平衡，并在城乡二元结构的现实中逐渐形成了一种“城市中心”的价值取向，它直接影响了高考招生政策。
二、研究型大学招生的本地化倾向。伴随高等学校管理体制改革，以及在建设“211”和“985”高校的过程中，实行中央和地方政府共建的政策，导致研究型大学招生的本地化倾向。以2004年为例，一些研究型大学招收本地学生的比例竟达到50％左右，最高的中山大学达到67％。这意味着侵占了其他省市学生享受优质教育资源的机会。这些高校主要是由中央财政举办的，理应面向全国招生，而不应主要为本省服务。
三、不合理的特殊政策加剧了教育不公。在高校招生中，我们在统一的分数线之外还制定了许多特殊政策、开辟了许多特殊通道，如特长生、保送生、定向生、调剂生，等等。这些政策在制定时的初衷是好的，但许多做法在现实中已逐渐变质，失去了原来的意义。比较典型的如保送生政策，以及极易作假、标准模糊的“三好学生”、优秀学生干部加分政策等。
四、高考舞弊和教育腐败。在高考和招生中出现的高考舞弊、钱学交易等腐败行为，赤裸裸地侵犯了考试公正和教育公平，为人们所痛恨。其对教育公平的伤害远远大于任何一种制度或政策性的偏差，必需特别重视和防范。
以上不同的问题，加深了我们对维护教育公平的认识。对于历史形成的发展差距，公正的教育资源配置应当体现；通过恰当的配置不再人为地继续扩大这一差距，并且在可能的情况下尽量向弱势地区倾斜，主动缩小差距。在高等教育的持续发展中，通过增量改革缩小地区差距是稳妥可行的。研究型大学如何平衡国家整体利益和地方利益，需要深入研究并进行测算，加以调整改革。同样，对各种特殊政策应当作出实事求是的评价，在此基础上区别对待，予以清理。
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