基础医学部下设4个行政科室，15个教研室，5个实验室和3个实验中心，是以培养医学人才为主体的重要教学单位，每年承担学校近43 %的教学任务。拥有1个博士后科研流动站（基础医学），1个博士授予点（病理与病理生理学方向），7个硕士学位授予点，1个基础医学本科专业（医学生物技术方向），4个省级重点学科，8门省级精品课程。
近5年来，基础医学院获国家自然科学基金科研项目15项，973子课题1项，教育部重点科研项目1项，教育部“春晖计划”科研合作项目2项，教育部高等学校博士学科点专项基金2项，贵州省优秀人才省长基金项目、贵州省优秀青年人才项目、贵州省委组织部特助经费、贵州省科技攻关项目、贵州省科技基金、贵州省国际合作项目、贵州省教育厅基金、贵州省卫生厅基金等项目143项，市、院级科研项目55项，合计资助金额达1400万余元。国内外公开发表论文近600篇，其中核心期刊327余篇，SCI收录29篇，主编教材8部，参编教材27部。
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