水产养殖专业为广东省名牌专业，国家特色专业建设点，水产养殖学科为省级重点学科，本专业具有硕士学位授予权。
（1）水产经济动植物增养殖方向
培养目标：培养具有坚实的生物学和水域环境科学的基础理论知识，掌握水产经济动植物增养殖的基本理论、基本知识和基本技能，具有从事内陆水域和浅海水产经济动植物增养殖、病害防治及相关专业的生产、经营、管理、教学和研究开发能力的高级水产科学技术人才。本科学制四年。
主要课程：动物学、水生生物学、鱼类学、海产经济无脊椎动物生物学、组织胚胎学、鱼类生理学、微生物学、遗传育种学、生物化学、生态学、浅海海洋学、水化学与水质管理、淡水经济动物增养殖学、海产经济动物增养殖学、海藻与海藻栽培学、生物饵料培养、水产养殖工程学、水产动物病害防治学、水产动物营养与饲料学、企业经营管理学等。
（2）水产经济动物病害防治方向
培养目标：培养具有坚实的生物学和水域环境科学的基础理论知识，掌握水生经济动物病害监测、疾病诊断与防治的基本理论、基本知识和基本技能，具有从事水产经济动物病害防治、水产药物、水产养殖及相关专业的生产、管理、教学和研究开发能力的高级水产科学技术人才。本科学制四年。
主要课程：动物学、水生生物学、鱼类学、海产经济无脊椎动物生物学、组织胚胎学、鱼类生理学、微生物学、遗传育种学、生物化学、生态学、浅海海洋学、水化学与水质管理、水产增养殖学、水产动物营养与饲料学、水产动物病害防治学、病毒学、细菌分类学、病理学、免疫学、水产药物与药理学、企业经营管理学等。
（3）水产动物营养与饲料方向
培养目标：培养具有坚实的生物学和水域环境科学的基础理论知识，掌握水产动物营养、饲料加工工艺与技术的基本理论、基本知识和基本技能，具有从事水产动物饲料、水产养殖及相关专业的生产、管理、教学和研究开发能力的高级水产科学技术人才。本科学制四年。
主要课程：动物学、水生生物学、鱼类学、海产经济无脊椎动物生物学、组织胚胎学、鱼类生理学、微生物学、遗传育种学、生物化学、生态学、浅海海洋学、水化学与水质管理、水产增养殖学、水产动物病害防治学、水产动物营养学、生物饵料培养、饲料学、饲料加工工艺与设备、饲料检测与分析、饲料添加剂、企业经营管理学等。
本专业从第三学年起，学生可根据社会的需求和本人意愿，在以上三个专业方向中选择一个专业方向。
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