根据教育部印发的《普通高等学校高等职业教育（专科）专业设置管理办法》的有关要求，学院按照教育部《普通高等学校高等职业教育（专科）专业目录（2015年）》对部分专业进行了调整，从2016年起，学院招生按新《目录》执行，现在校生仍按原专业培养至毕业。具体专业调整情况如下：
原港口机械应用技术、港口物流设备与自动控制两个专业合并为港口机械与自动控制专业，该专业分为港口机械、自动控制两大方向；原港口工程技术专业变更为港口与航道工程技术专业；原港口业务管理、国际航运业务管理两个专业合并为港口与航运管理专业，该专业分为港口管理、航运管理两大方向；原汽车技术服务与营销专业变更为汽车营销与服务专业；原房地产经营与估价专业变更为房地产经营与管理专业；另外我院新增水路运输与海事管理专业，该专业自2016年起开始招生。
专业调整后，学院共有30个专业，专业结构更加合理，主要以涉港涉海专业为支撑，重点面向国内外港航及关联产业培养高素质技术技能型人才。
