从2016年开始，福建省教育考试院网将开通“自学考试课程免考预申请系统”，系统开通时间：上半年1月15日至2月15日，下半年7月15日至8月15日。系统登录：登录福建省教育考试院网（www.eeafj.cn）点击“自学考试”专栏图标，选择“自学考试网上报名”图标，进入“福建省高等教育自学考试考务考籍管理信息系统”（具体操作可详见系统帮助）。
系统开通期间，考生根据《福建省高等教育自学考试课程免考实施细则》（http://www.eeafj.cn/zkzkzc/）有关规定：凡用学历证书申请免考自考课程的以及无法通过网上免考的非学历证书申请免考自考课程的，均要登录系统进行课程免考预申请。并在课程免考现场确认期间（上半年2月15日——3月1日，下半年8月15日——9月1日（不含法定节假日、双休日）），到市、县（区）教育招生考试机构（试点专业到各主考学校自考办）提交免考材料，规定时间内未到现场确认的考生，课程免考预申请无效。
考生可登入系统实时查看审核进度及情况。终审结束（上半年5月1日、下半年11月1日）后，系统将开通打印“福建省自学考试课程免考审核情况表”，考生打印后，请妥善保管。
