未来15年，按照建设创新型国家的总体要求，我国农业科技工作将贯彻“自主创新，加速转化，提升产业，率先跨越”的方针，在六大领域形成一批拥有自主知识产权的核心技术，降低对外技术的依存度。
加强动植物新品种的自主创新，为提高农业综合生产能力提供良种保障。突破种子种苗规模化繁育技术和综合生产加工技术，培育新一代动植物超级种、优质种和特色种。在亩产900公斤超级稻、超级小麦、三系转基因杂交抗虫棉、杂交大豆等品种培育方面取得较大突破，在猪、牛、羊、禽和水产等优质品种培育方面取得明显进展。
开发优质高效安全生产技术，为确保农产品质量安全提供保障。建立高效健康种养模式和生物灾害、外来入侵物种监测预警与防控技术体系，创制一批基因工程疫苗、生物农药、生物月巴料、饲料添加剂等高效安全农业生物制剂，在禽流感、口蹄疫、蝗虫、稻瘟病、小麦锈病等重大农业生物灾害防控方面取得重大突破。
发展农产品精深加工新技术，为促进农产品转化增值提供保障。开发高附加值工业产品、医药中间体、功能性健康食品和配料等，力争在“十一五”时期末主要农产品深加工比例提高到40％，促进食品加Z-.业的技术进步和产业升级。
开发农业生态环境保护和资源综合利用技术，为发展循环农业提供保障。大力开发和应用节地、节水、节肥、节药、节种等实用技术，重点突破生物节水、农艺节水等水资源安全高效利用技术，研发多功能、智能化节水农业关键设备与重大产品。加强源头控制、过程治理以及末端资源化治理等农业面源污染防治核心技术的攻关。
开发农业工程技术与智能化装备，为发展高效农业提供保障。在粮食作物、经济作物、畜牧水产养殖、农产品产地加工等成套技术装备开发方面取得突破，显著提高我国农业装备现代化水平。重点研究农业环境调控、超高产高效栽培等设施农业技术等，提高农业劳动生产率。
加强基础研究与高新技术领域研究，为提高农业科技持续创新能力提供保障。在功能基因组、植物高光效机理、生物固氮、抗旱机理、动物克隆、生物反应器等应用基础理论研究和农业高技术研究领域取得一批原创性成果。在生物技术领域，重点克隆一批优质、抗虫、抗病、抗除草剂、抗旱、耐盐碱和品质改良的动植物基因，加大转基因技术研发力度和安全性评价研究，抢占前沿领域的制高点。
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