学院历史 食品科学系于1988年成立，2004年院系合并后成立食品科学与工程学院。1989年开始招本科生，2002年开始招收“农产品加工及贮藏工程”硕士研究生，2004年开始招收“食品科学”与“营养与食品卫生学”硕士研究生，2005年开始招收“动物食品营养与工程”硕士和博士研究生。
学科建设 学院现有动物食品营养与工程二级学科博士学位授权点1个，食品科学与工程一级学科硕士学位授权点1个，食品科学、农产品加工与贮藏工程、营养与食品卫生学、动物食品营养与工程二级学科硕士学位授权点4个，食品加工与安全（农业推广）专业硕士和食品工程专业工程硕士学位授权点各1个，食品科学与工程、食品质量与安全和生物工程三个全日制本科专业。目前，学院现有全日制本科生1045人，硕士研究生165名，博士研究生12人。
师资队伍 学院现有教职员工44人，其中教授7人、副教授10人，其中博士生导师5人、硕士生导师16人。教师中有国家肉牛牦牛产业技术体系岗位专家1人，教育部新世纪人才1人，甘肃省领军人才一二层次人选2人，甘肃省“333”人才工程2人、“555”人才工程3人。
科学研究 学院在乳品科学与技术、肉品科学与技术、果蔬采后生物学与技术、果蔬品质与加工、粮油加工、发酵微生物、葡萄酒品质与酿造等多方面开展科学研究，其中在果蔬采后生物学、乳品科学与技术、牛羊肉加工等方面达到国内领先水平。2006年以来，先后主持国家和省部级各类项目46项，其中国家科技支撑计划子项目3项，国家自然基金8项，国家科技部星火项目1 项，科技部科技人员服务企业项目6项，教育部“新世纪优秀人才支持计划”1项，农业部产业体系项目2项，甘肃省科技重大专项3项，甘肃省科技厅支撑计划项目2项等，累积科研经费825万元。此外，还承担地区性企业横向合作项目18项，累计经费353万元。先后获国家科技进步二等奖1项、省部级科技进步奖10项，其中一等奖2项、二等奖1项、三等奖7项；厅局级科技进步奖18项，获得发明专利19项。在专业学术期刊上发表论文450余篇，其中SCI 20篇，EI 10篇，ISTP 8篇。出版专著4部，主编、参编教材28部，其中全国统编教材9部。
办学条件 学院现有乳品科学与技术、肉品科学与技术、采后生物学与技术、果蔬品质与加工、葡萄酒品质及酿造、粮油加工、食品微生物7个专业实验室，果蔬加工、葡萄酒酿造和乳品加工3个中试车间，累计实验面积4982m2，仪器设备总值1075万元。同时，建有甘肃省农畜产品加工贮藏重点实验室、甘肃省畜产品工程技术研究中心、甘肃省果蔬加工示范实验、甘肃省食品科学与工程实验教学示范中心、甘肃省葡萄酒产业技术研发中心、甘肃省干酪素工程技术研究中心、甘肃省功能乳品工程实验室和甘肃省乳品行业技术中心等多个省级实验室和技术中心。此外，学院还在甘肃省轻工业科学研究院、甘肃省进出口商品检疫检局中心实验室、甘肃长城果汁有限责任公司、甘肃莫高实业股份有限公司、甘肃圣大方舟马铃薯淀粉有限公司等三十多家企事业单位建立了校外教学科研实践基地，为学生的培养提供了良好的保障。
培养能力 学院已为社会培养了1600多名研究生和本科生，现有在校全日制本科生1045名、硕士生165名、博士生12名。自1994年以来连续开办食品科学与工程专业高等教育自学考试应用型专科和本科辅导班，已培养2600多人。学院已形成了具有博士、硕士、本科多层次的高等教育体系。学院每年招收全日制本科生270人、硕士研究生70人、博士研究生6人。
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