荚膜(Capsule)
许多细菌胞壁外围绕一层较厚的粘性、胶冻样物质。大多数细菌(如肺炎球菌、脑膜炎球菌等)的荚膜由多糖组成。荚膜除对鉴别细菌有帮助外，还能保护细菌免遭吞噬细胞的吞噬和消化作用，因而与细菌的毒力有关。荚膜抗吞噬的机理还不十分清楚，可能由于荚膜粘液层比较光滑，不易被吞噬细胞捕捉之故。荚膜能贮留水分使细菌能抗干燥，并对其他因子(如溶菌酶、补体、抗体、抗菌药物等)的侵害有一定抵抗力。
鞭毛(Flagllum)
在某些细菌菌体上具有细长而弯曲的丝状物，称为鞭毛。鞭毛是细菌的运动器官，往往有化学趋向性，常朝向有高浓度营养物质的方向移动，而避开对其在害的环境。
菌毛(Pilus)
菌毛是许多革兰氏阴性菌菌体表面遍布的比鞭毛更为细、短、直、硬、多的丝状蛋白附属器，也叫做纤毛(Fimbriae)。菌毛与运动无关。菌毛可分为普通菌毛(Commonpilus)和性菌毛(Sexpilus)两种。
芽胞(Spore)
在一定条件下，芽胞杆菌属(如炭疽杆菌)及梭状芽胞杆菌属(如破伤风杆菌、气性坏疽病原菌)能在菌体内形成一个折光性很强的不易着色小体，称为内芽胞(Endospore)，简称芽胞
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